DESseq2

Heatmap

Figure 1: heatmap des similarités entre échantillons basée sur les écarts des distances euclidiennes. La matrice de comptage utilisée est issue d'un mapping STAR puis d'une quantification RSEM.

source : nf-core RNAseq MultiQC

La heatmap représente les valeurs comparatives obtenues après le calcul des distances euclidiennes dans l’ACP précédente. Ici, plus les carrés sont bleus, plus les échantillons sont proches ; plus ils sont rouges, plus ils sont éloignés. Ce graphique permet d'observer les différences entre échantillons.