Description des données

Les schémas et graphiques présentés dans ce GitBook proviennent, en grande partie, de la documentation des pipelines Nextflow nf-core.

Données SAREK

source : SAREK pipeline results

Les échantillons utilisés sont des données pairées du génome humain, obtenues par séquençage Illumina HiSeq 1500 (SRR7890918(HCC1395T) et SRR7890919(HCC1395N)). Ces données sont issues du séquençage clinique de tumeurs.

Figure 1 : pipeline SAREK

Le pipeline SAREK a pour but de détecter les variants dans les séquences, lors de leur comparaison avec un génome de référence.