Contenu en N des lectures

Figure 1 : taux de N moyen des lectures pour chaque échantillon avant filtre.

Source : SAREK example MultiQC Nextflow/nf-core

Dans la figure 1, la position des lectures est indiquée sur l'axe des abscisses et le taux de N moyen des lectures sur l'axe des ordonnées. Les 2 échantillons sont indiqués dans le graphique mais ils se superposent. La figure 1 montre des valeurs très basses. C'est ce à quoi l'on s'attend pour des échantillons de grandes qualités.

Figure 2 : taux de N moyen des lectures pour chaque échantillon après filtre.

Source : SAREK example MultiQC Nextflow/nf-core

On peut clairement voir qu'il n'y a pas de grandes évolutions après filtre, ce qui veut dire que le séquençage s'est très bien passé et que les données sont de très grande qualité.