RSeQC

Distribution des lectures

Figure 1 : diagramme en barres des caractéristiques génomiques des lectures pour chaque échantillon.

source : nf-core RNAseq MultiQC

Chaque échantillon indiqué en ordonnée est divisé en pourcentage sur l'axe des abscisses.

Légende:

CDS_Exons fait référence à la partie codante de chaque exon (à l’exclusion des 5’ UTR ou 3’ UTR). 5’UTR_Exons désigne la partie 5’ UTR des exons, et 3’UTR_Exons désigne la partie 3’ UTR des exons. Introns est explicite. TSS_up_1kb/1kb-5kb/5kb-10kb correspond aux sites de démarrage de la transcription, divisés en trois parties : jusqu’à 1 kb, 1-5 kb, et 5-10 kb. TES_down_1kb/1kb-5kb/5kb-10kb correspond aux sites de fin de transcription, également divisés en trois parties : jusqu’à 1 kb, 1-5 kb, et 5-10 kb. Other_intergenic contient le centromère et d’autres régions non définies.

Pour les données RNAseq, vous devriez observer une majorité de CDS et de terminaisons UTR. Cependant, il est normal de trouver des introns venant de gènes très exprimés.