RseQC

RseQC est un outil de contrôle de qualité de données issues de séquençage à haut débit. Il est spécialisé en données RNAseq.

Ici se trouve le lien vers l’article de présentation de l’outil.

Il a été réalisé par Liguo Wang, Wei Li et Shengqin Wang.

Dans le cadre du pipeline Nextflow nf-core/RNAseq, RSeQC est lancé dans la "partie 5 : statistiques". L'outil fournit différentes statistiques sur les transcrits et les lectures.

Figure 1 : pipeline RNAseq simplifié.