RSEM

RSEM est un outil de quantification des données RNAseq. Il peut être utilisé avec ou sans génome de référence.

Il a été réalisé par Bo Li et Colin N Dewey.

Voici le lien vers les issues du Gitlab en cas de problème.

Dans le cadre du pipeline Nextflow nf-core/RNAseq, RSEM est lancé dans la "partie 3 : quantification".

Figure 1 : pipeline RNAseq simplifié.